A Vatikáni vizsgálatot követően a ciszterci apátság függetlenedik a KDNP-től.

A Vatikán lépései a ciszterci intézmények munkatársainak panaszaira reagálva kezdődtek, és fő céljuk a zirci pénzügyi anomáliák felderítése volt.
Bő másfél évvel ezelőtt a Vatikán hivatalos eljárást indított a Zirci Ciszterci Apátság ellen. A vizsgálat során napvilágra kerültek olyan részletek, amelyek az iskoláknak járó, de visszatartott állami támogatásokkal, kirakatvállalkozásokkal és a belügyminiszter-helyettes köréhez fűződő kapcsolatokkal foglalkoztak. A művelet idején Bérczi L. Bernát apát pozícióját megváltoztatták.
A Válasz Online tudósítása szerint a Vatikán eljárása a ciszterci intézményekben dolgozók panaszai nyomán indult, és célja a zirci pénzügyi anomáliák feltárása. A vizsgálat során napvilágra került, hogy Rétvári Bence belügyminiszter-helyettes köré épült alapítványi hálózat hogyan bánik a ciszterci központ egyik belső "cégével". A nyomozás során kiderült, hogy az állami forrásokat, amelyek hivatalosan egyházi célra lettek elkülönítve, valójában saját érdekeik szolgálatába állították, ingatlanokat és pénzügyi forrásokat csatornázva magukhoz.
Mauro-Giuseppe Lepori, a rend generális apátja által kiadott nyilatkozat alapján az eljárás lezárult. Az információk szerint sikerült stabilizálni az oktatási intézmények működését, és új vezetést neveztek ki a szervezet élére. Az apátság felügyeletét azonban továbbra is egy pápai biztosi testület látja el. A közleményben említésre kerül, hogy a korábbi gazdasági vezető elhagyta az egyház kötelékét, míg a volt zirci apát a Vatikántól kérte a rendből való távozásának hivatalos jóváhagyását, valamint a papság alóli felmentését.
A helyzet különös bonyolultságát adja, hogy a két kulcsszereplő, Grónai Gábor Damján gazdasági vezető és Bérczi László Bernát exapát, már nem állnak az egyház szolgálatában. Ezzel gyakorlatilag akadályozták a vizsgálat lefolytatását, hiszen egyházi büntetés nem alkalmazható olyan személyekkel szemben, akik már kiléptek a katolikus egyház kereteiből.
Jelenleg a Zirci Ciszterci Apátság tagjai között kilenc férfi szerzetes található. Az utánpótlás létszáma csupán egy fő, ami azt jelenti, hogy Zirc a tengerentúli apátság irányítása alá kerülne. Ez a változás azt vonja magával, hogy az amerikai rendi elöljáró, Peter Verhalen, lelkipásztorokat küldene Magyarországra. Ezzel a KDNP-s üzleti kör és a szerzetesrend között véglegesen megszűnne a kapcsolat.